mussa_exceptions.hpp

   1 #ifndef _MUSSA_EXCEPTIONS_H_
   2 #define _MUSSA_EXCEPTIONS_H_
   3 #include <stdexcept>
   4 #include <boost/filesystem/exception.hpp>
   5
   6 //! base mussa exception
   7 class mussa_error : public std::runtime_error
   8 {
   9 public:
  10   explicit mussa_error(const std::string& msg): std::runtime_error(msg) {};
  11 };
  12
  13 //! Error processing commandline arguments
  14 class cmdline_error : public mussa_error
  15 {
  16 public:
  17   explicit cmdline_error(const std::string& msg): mussa_error(msg) {};
  18 };
  19
  20 //! Error loading information
  21 class mussa_load_error : public mussa_error
  22 {
  23 public:
  24   explicit mussa_load_error(const std::string& msg) :
  25     mussa_error(msg) {};
  26 };
  27
  28 //! Error loading sequence
  29 class sequence_load_error : public mussa_load_error
  30 {
  31 public:
  32   explicit sequence_load_error(const std::string& msg) :
  33     mussa_load_error(msg) {};
  34 };
  35
  36 // Empty sequence
  37 class sequence_empty_error : public sequence_load_error
  38 {
  39 public:
  40   explicit sequence_empty_error(const std::string& msg) :
  41     sequence_load_error(msg) {};
  42 };
  43
  44 // Empty fasta file
  45 class sequence_empty_file_error : public sequence_load_error
  46 {
  47 public:
  48   explicit sequence_empty_file_error(const std::string& msg) :
  49     sequence_load_error(msg) {};
  50 };
  51
  52
  53 //! failure running analysis
  54 class mussa_analysis_error : public mussa_error
  55 {
  56 public:
  57   explicit mussa_analysis_error(const std::string& msg) :
  58     mussa_error(msg) {};
  59 };
  60
  61 class motif_normalize_error : public mussa_error
  62 {
  63 public:
  64   explicit motif_normalize_error(const std::string& msg) :
  65     mussa_error(msg) {};
  66 };
  67
  68 //! ConservedPath::nextTo had two paths that weren't the same size
  69 class conserved_path_size_mismatch : public mussa_error
  70 {
  71 public:
  72   explicit conserved_path_size_mismatch(const std::string& msg) :
  73     mussa_error(msg) {};
  74 };
  75 #endif