mussa_gui_load_window.hh

   1 //  This file is part of the Mussa source distribution.
   2 //  http://mussa.caltech.edu/
   3 //  Contact author: Tristan  De Buysscher, tristan@caltech.edu
   4
   5 // This program and all associated source code files are Copyright (C) 2005
   6 // the California Institute of Technology, Pasadena, CA, 91125 USA.  It is
   7 // under the GNU Public License; please see the included LICENSE.txt
   8 // file for more information, or contact Tristan directly.
   9
  10
  11 #include "mussa_gui_annot_window.hh"
  12 #include <FL/Fl_File_Chooser.H>
  13 #include <FL/Fl_Scroll.H>
  14
  15 class SetupWindow : public Fl_Window
  16 {
  17   public:
  18     SetupWindow(int w, int h, const char* title, Mussa *an_analysis);
  19     ~SetupWindow();
  20
  21     bool done();
  22
  23   //did I put these in public for a reason?
  24     Fl_Button* test;
  25     Fl_Input *name_input;
  26     Fl_Input *win_input;
  27     Fl_Input *thres_input;
  28     Fl_Input *seq_num_input;
  29     Fl_Scroll *seq_scroll;
  30     // need to keep track of these so a browsed file search can set the input
  31     // fields to teh selected file
  32     vector<Fl_Input*> seq_inputs, annot_inputs;
  33
  34
  35     // callback receiver functions
  36
  37     void real_do_analysis();
  38
  39     void real_set_ana_name_cb(Fl_Input* o);
  40     void real_set_win_size_cb(Fl_Input* o);
  41     void real_set_threshold_cb(Fl_Input* o);
  42     void real_set_seq_num_cb(Fl_Input* o);
  43
  44     void real_seq_file_in_cb(Fl_Input* o, int i);
  45     void real_choose_seq_file_cb(int i);
  46     void real_annot_file_in_cb(Fl_Input* o, int i);
  47     void real_choose_annot_file_cb(int i);
  48
  49     void real_fa_index_in_cb(Fl_Input* o, int i);
  50     void real_sub_start_in_cb(Fl_Input* o, int i);
  51     void real_sub_end_in_cb(Fl_Input* o, int i);
  52
  53   private:
  54     Mussa *an_analysis;
  55     string ana_name;
  56     int window, threshold, seq_num;
  57     vector<string> seq_files, annot_files;
  58     vector<int> fasta_indices, sub_seq_starts, sub_seq_ends;
  59     bool win_append, thres_append;
  60
  61     bool all_done;
  62     static void print_cb(Fl_Button*, void*);
  63     inline void print_cb_real(Fl_Button*, void*);
  64
  65     void add_seq_input(int index);
  66 };
  67
  68 // crazy whacked shite Titus taught me to do to get an index value associated
  69 // with each instance of an input associated with the callback...
  70
  71 struct seq_data_instance
  72 {
  73   SetupWindow * sw_ptr;
  74   int index;
  75 };