mussa_gui_seq.cc

   1 //  This file is part of the Mussa source distribution.
   2 //  http://mussa.caltech.edu/
   3 //  Contact author: Tristan  De Buysscher, tristan@caltech.edu
   4
   5 // This program and all associated source code files are Copyright (C) 2005
   6 // the California Institute of Technology, Pasadena, CA, 91125 USA.  It is
   7 // under the GNU Public License; please see the included LICENSE.txt
   8 // file for more information, or contact Tristan directly.
   9
  10
  11 #include "mussa_gui_seq.hh"
  12 #include <sstream>
  13
  14
  15 void
  16 set_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
  17 {
  18   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
  19   SeqWindow* T= blah->swm_ptr;
  20   T->real_set_align_cb(blah->which_align);
  21 }
  22
  23
  24 void
  25 SeqWindow::real_set_align_cb(int which_align)
  26 {
  27   vector<int> a_path;
  28   int window_length;
  29
  30
  31   a_path = *P.begin();
  32   window_length = a_path[0];
  33   cout << window_length << endl;
  34
  35   cout << "fum1\n";
  36   seq_box->align_offsets(which_align);
  37   seq_box->redraw();
  38 }
  39
  40
  41 void
  42 show_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
  43 {
  44   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
  45   SeqWindow* T= blah->swm_ptr;
  46   T->real_show_align_cb(blah->which_align);
  47 }
  48
  49
  50 void
  51 SeqWindow::real_show_align_cb(int which_align)
  52 {
  53   vector<int> a_path;
  54   int window_length;
  55
  56
  57   cout << "fumish\n";
  58   seq_box->toggle_align(which_align);
  59   seq_box->redraw();
  60 }
  61
  62
  63 void
  64 toggle_bars_cb(Fl_Button* o, void* v)
  65 {
  66   SeqWindow* T=(SeqWindow*)v;
  67   T->real_toggle_bars_cb();
  68 }
  69
  70
  71 void
  72 SeqWindow::real_toggle_bars_cb()
  73 {
  74   seq_box->toggle_bars();
  75 }
  76
  77
  78 void
  79 toggle_motifs_cb(Fl_Button* o, void* v)
  80 {
  81   SeqWindow* T=(SeqWindow*)v;
  82   T->real_toggle_motifs_cb();
  83 }
  84
  85
  86 void
  87 SeqWindow::real_toggle_motifs_cb()
  88 {
  89   seq_box->toggle_motifs();
  90 }
  91
  92
  93 // main code, window creation
  94
  95 SeqWindow::SeqWindow(int w, int h, const char* title, int sq_num,
  96                      vector<Sequence> *some_seqs,
  97                      list<vector<int> > some_paths,
  98                      vector<int> some_lens,
  99                      vector<motif> *some_motifs):
 100   Fl_Double_Window(w,h,title)
 101 {
 102   menu_align_data_bundle * some_menu_data;
 103   vector<int> a_path;
 104   int window_length, align_number;
 105   int i;
 106   ostringstream align_id_ostr;
 107   string align_id_string;
 108   list<vector<int> >::iterator align_iter;
 109
 110
 111
 112   // most of this stuff is here just to pass to SeqView object
 113   // some is needed to setup the window menus
 114   seq_num = sq_num;
 115   S = some_seqs;
 116   P = some_paths;
 117   seq_lens = some_lens;
 118   the_motifs = some_motifs;
 119
 120
 121   begin();
 122   color(FL_WHITE);
 123   resizable(this);
 124
 125   // make the menu that allows alignment selection
 126   choose_align_menu = new Fl_Menu_Button(5, 2, 180, 30, "Choose Alignment");
 127   choose_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 128   choose_align_menu->box(FL_BORDER_BOX);
 129   choose_align_menu->clear();
 130
 131   // make the menu that allows alignment selection
 132   show_align_menu = new Fl_Menu_Button(190, 2, 180, 30, "Show Alignment");
 133   show_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 134   show_align_menu->box(FL_BORDER_BOX);
 135   show_align_menu->clear();
 136
 137
 138   // adds menu items for each path
 139   align_iter = P.begin();
 140   align_number = 0;
 141   while(align_iter != P.end())
 142   {
 143     some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 144     some_menu_data->swm_ptr = this;
 145     some_menu_data->which_align = align_number;
 146     align_id_ostr << (*align_iter)[0] << ": ";
 147     for(i = 1; i <= seq_num; i++)
 148       align_id_ostr << (*align_iter)[i] << ", ";
 149     align_id_string = align_id_ostr.str();
 150     choose_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 151                            (Fl_Callback *) set_align_cb,
 152                            (void*) some_menu_data);
 153     show_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 154                          (Fl_Callback *) show_align_cb,
 155                          (void*) some_menu_data, FL_MENU_TOGGLE|FL_MENU_VALUE);
 156
 157     align_id_ostr.str("");
 158     ++align_number;
 159     ++align_iter;
 160   }
 161
 162   /*
 163   show_align_menu->add("f&ee");
 164   show_align_menu->add("f&ie");
 165   show_align_menu->add("f&oe");
 166   show_align_menu->add("f&um");
 167   */
 168
 169   Fl_Button *test_but = new Fl_Button(375, 2, 150, 30, "Toggle Motifs");
 170   test_but->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 171   test_but->box(FL_BORDER_BOX);
 172   test_but->callback((Fl_Callback*) toggle_motifs_cb, this);
 173
 174   toggle_bars = new Fl_Button(530, 2, 150, 30, "Toggle 10bp bars");
 175   toggle_bars->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 176   toggle_bars->box(FL_BORDER_BOX);
 177   toggle_bars->callback((Fl_Callback*) toggle_bars_cb, this);
 178
 179
 180   // make the view of the sequence
 181   seq_box = new SeqView(0, 34, w, h-34);
 182   seq_box->setup(ana_name, seq_num, S, P, seq_lens, the_motifs);
 183   //real_set_align_cb(2);
 184
 185   end();
 186   Fl::visual(FL_DOUBLE|FL_INDEX);
 187   show();
 188 }
 189
 190
 191
 192 /*
 193   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 194   some_menu_data->swm_ptr = this;
 195   some_menu_data->which_align = 2;
 196   choose_align_menu->add("f&ie", FL_ALT+'i', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 197                   (void*) some_menu_data);
 198
 199   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 200   some_menu_data->swm_ptr = this;
 201   some_menu_data->which_align = 3;
 202   choose_align_menu->add("f&oe", FL_ALT+'o', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 203                   (void*) some_menu_data);
 204
 205   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 206   some_menu_data->swm_ptr = this;
 207   some_menu_data->which_align = 4;
 208   choose_align_menu->add("f&um", FL_ALT+'u', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 209                   (void*) some_menu_data);
 210 */
 211
 212
 213
 214