mussa_gui_seq_text.cc

   1 //  This file is part of the Mussa source distribution.
   2 //  http://mussa.caltech.edu/
   3 //  Contact author: Tristan  De Buysscher, tristan@caltech.edu
   4
   5 // This program and all associated source code files are Copyright (C) 2005
   6 // the California Institute of Technology, Pasadena, CA, 91125 USA.  It is
   7 // under the GNU Public License; please see the included LICENSE.txt
   8 // file for more information, or contact Tristan directly.
   9
  10
  11 #include "mussa_gui_seq_text.hh"
  12
  13
  14 void
  15 get_seq_cb(Fl_Button* o, void* v)
  16 {
  17   SeqTextWin* T=(SeqTextWin*)v;
  18   T->real_get_seq_cb();
  19 }
  20
  21 void
  22 SeqTextWin::real_get_seq_cb()
  23 {
  24   string sub_seq_formatted;
  25   int seq_len, i, line_len;
  26
  27
  28   cout << "length = " << seq_end-seq_start << endl;
  29
  30   // make sure inputed values within valid ranges
  31   if ((seq_end > seq_start) && (seq_id > -1) && (seq_id < the_Seqs.size()) )
  32   {
  33     sub_sequence = the_Seqs[seq_id].subseq(seq_start, seq_end-seq_start);
  34
  35     sub_seq_formatted = "";
  36     seq_len = sub_sequence.size();
  37     line_len = 40;
  38     for (i = 0; i < seq_len; i += line_len)
  39     {
  40       sub_seq_formatted.append(sub_sequence.substr(i,line_len));
  41       sub_seq_formatted.append("\n");
  42     }
  43
  44     seq_display->value((const char *)sub_seq_formatted.c_str());
  45   }
  46 }
  47
  48
  49 // *** input seq index id
  50
  51 void
  52 set_seq_id_cb(Fl_Input* o, void* v)
  53 {
  54   SeqTextWin* T=(SeqTextWin*)v;
  55   T->real_set_seq_id_cb(o);
  56 }
  57
  58 void
  59 SeqTextWin::real_set_seq_id_cb(Fl_Input* o)
  60 {
  61   seq_id = atoi(o->value()) - 1;   // -1 since arrays start at 0
  62 }
  63
  64
  65 // *** input seq start index
  66
  67 void
  68 set_seq_start_cb(Fl_Input* o, void* v)
  69 {
  70   SeqTextWin* T=(SeqTextWin*)v;
  71   T->real_set_seq_start_cb(o);
  72 }
  73
  74 void
  75 SeqTextWin::real_set_seq_start_cb(Fl_Input* o)
  76 {
  77   seq_start = atoi(o->value());
  78 }
  79
  80 // *** input seq end index
  81
  82 void
  83 set_seq_end_cb(Fl_Input* o, void* v)
  84 {
  85   SeqTextWin* T=(SeqTextWin*)v;
  86   T->real_set_seq_end_cb(o);
  87 }
  88
  89 void
  90 SeqTextWin::real_set_seq_end_cb(Fl_Input* o)
  91 {
  92   seq_end = atoi(o->value());
  93 }
  94
  95
  96 SeqTextWin::SeqTextWin(int w, int h, const char* title,
  97                        vector<Sequence> some_Seqs):Fl_Window(w,h,title)
  98 {
  99   string a_name;
 100   color(FL_WHITE);
 101   the_Seqs = some_Seqs;
 102
 103
 104   seq_id = -1;
 105   seq_start = 1000000;
 106   seq_end = -1000000;
 107
 108   begin();
 109
 110   seq_id_input = new Fl_Input(80,10,30,30, "Seq num: ");
 111   seq_id_input->value("");
 112   seq_id_input->callback((Fl_Callback*)set_seq_id_cb, this);
 113
 114   seq_start_input = new Fl_Input(160,10,100,30, " start: ");
 115   seq_start_input->value("");
 116   seq_start_input->callback((Fl_Callback*)set_seq_start_cb, this);
 117
 118   seq_end_input = new Fl_Input(310,10,100,30, "end: ");
 119   seq_end_input->value("");
 120   seq_end_input->callback((Fl_Callback*)set_seq_end_cb, this);
 121
 122   seq_display = new Fl_Multiline_Output(10, 50, w-20, h-60, "");
 123   seq_display->value("");
 124
 125   //seq_display2 = new Fl_Text_Display(10,100, w-20, h-110,"");
 126
 127   // button to get the sequence
 128   get_seq_but = new Fl_Button(w-80,10,80,30,"Get Seq");
 129   get_seq_but->callback((Fl_Callback*)get_seq_cb, this);
 130
 131
 132   end();
 133   //resizable(this);
 134   show();
 135 }
 136
 137
 138 SeqTextWin::~SeqTextWin(){}
 139
 140 /*
 141   cout << "fee\n";
 142   cout << "fie\n";
 143   cout << "foe\n";
 144   cout << "fum\n";
 145 */