qui/PathWindow.hpp

   1 #ifndef _PATHWINDOW_H_
   2 #define _PATHWINDOW_H_
   3
   4
   5
   6 #include <QMainWindow>
   7 #include <QPixmap>
   8 #include <QSpinBox>
   9 #include <QToolBar>
  10
  11 #include "qui/PathWidget.hpp"
  12 #include "qui/ThresholdWidget.hpp"
  13
  14 class QAction;
  15 class Mussa;
  16
  17 class PathWindow : public QMainWindow
  18 {
  19   Q_OBJECT
  20
  21 public:
  22   PathWindow(Mussa* analysis=0, QWidget *parent=0);
  23
  24 public slots:
  25   //! display an about box, contemplating the politics of the author list
  26   void about();
  27
  28   //! \defgroup AnalysisFunctions Components related to running analyses
  29   //\@{
  30   //! open a window to collect the information needed to create a new analysis
  31   void createNewAnalysis();
  32   //! launch a sub analysis
  33   void createSubAnalysis();
  34   //\@}
  35
  36   //! \defgroup MotifHandling Handling of motif lists
  37   //\@{
  38   //! load motifs
  39   void loadMotifList();
  40   void saveMotifList();
  41   void toggleMotifs();
  42   //\@}
  43
  44   //! load a mussa parameter file (which specifies an analysis to run)
  45   void loadMupa();
  46   //! load a previously run analysis
  47   void loadSavedAnalysis();
  48   //! set the soft threshold used by the Nway_Path algorithm
  49   void setSoftThreshold(int thres);
  50
  51   void showMussaToolbar();
  52
  53   void promptSaveOpenGlPixmap();
  54
  55 protected:
  56   Mussa *analysis;
  57   // display our wonderful mussa output
  58   PathWidget path_view;
  59   QToolBar mussaViewTB;
  60   QSpinBox zoomBox;
  61   ThresholdWidget threshold;
  62
  63   QAction *aboutAction;
  64   QAction *closeAction;
  65   QAction *createNewAnalysisAction;
  66   QAction *createSubAnalysisAction;
  67   QAction *loadMotifListAction;
  68   QAction *loadMupaAction;
  69   QAction *loadSavedAnalysisAction;
  70   QAction *saveMotifListAction;
  71   QAction *showMussaViewToolbarAction;
  72   QAction *toggleMotifsAction;
  73   QAction *whatsThisAction;
  74   QAction *saveOpenGlPixmapAction;
  75
  76   //! initialze the actions
  77   void setupActions();
  78   //! initialize this windows menu object
  79   void setupMainMenu();
  80   //! stub function to fill in QActions
  81   void NotImplementedBox();
  82   //! update the PathScene with our analysis
  83   void updateAnalysis();
  84   //! update the view of conserved windows
  85   void updateLinks();
  86 };
  87
  88 #endif