qui/SubanalysisWindow.cpp

   1 #include "qui/SubanalysisWindow.hpp"
   2 #include "qui/MussaWindow.hpp"
   3
   4 #include "mussa_exceptions.hpp"
   5 #include "alg/mussa.hpp"
   6
   7 #include <QVBoxLayout>
   8 #include <QHBoxLayout>
   9 #include <QGridLayout>
  10
  11 SubanalysisWindow::SubanalysisWindow(MussaRef m, QWidget *parent)
  12   : QWidget(parent),
  13     analysis(m),
  14     window(0),
  15     threshold(0),
  16     table(0),
  17     ok(0),
  18     cancel(0)
  19 {
  20   QGridLayout *parameterLayout = new QGridLayout;
  21
  22   QLabel *thresholdLabel = new QLabel(tr("threshold (bp)"));
  23   parameterLayout->addWidget(thresholdLabel, 0, 0);
  24   threshold = new QSpinBox(this);
  25   threshold->setValue(8);
  26   parameterLayout->addWidget(threshold, 1, 0);
  27   QLabel *windowLabel = new QLabel(tr("window (bp)"));
  28   parameterLayout->addWidget(windowLabel, 0, 1);
  29   window = new QSpinBox(this);
  30   window->setValue(10);
  31   parameterLayout->addWidget(window, 1, 1);
  32
  33   ok = new QPushButton(tr("&OK"), this);
  34   ok->setEnabled( false );
  35   connect(ok, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(run()));
  36
  37   cancel = new QPushButton(tr("Cancel"), this);
  38   connect(cancel, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(abort()));
  39
  40   table = new QTableView(this);
  41   table->setModel(&model);
  42
  43   // layout buttons
  44   QHBoxLayout *buttonLayout = new QHBoxLayout;
  45   buttonLayout->addWidget(ok);
  46   buttonLayout->addWidget(cancel);
  47
  48   // layout verticle space
  49   QVBoxLayout *verticalLayout = new QVBoxLayout;
  50   verticalLayout->addLayout(parameterLayout);
  51   verticalLayout->addWidget(table);
  52   verticalLayout->addLayout(buttonLayout);
  53   setLayout(verticalLayout);
  54
  55   // now that we're all setup lets get notices when we're updated
  56   connect(&model, SIGNAL(rowsInserted(const QModelIndex&, int, int)),
  57           this, SLOT(modelUpdated(const QModelIndex&, int, int)));
  58   connect(&model, SIGNAL(rowsRemoved(const QModelIndex&, int, int)),
  59           this, SLOT(modelUpdated(const QModelIndex&, int, int)));
  60
  61   updateTitle();
  62 }
  63
  64 SequenceLocationModel& SubanalysisWindow::getModel()
  65 {
  66   return model;
  67 }
  68
  69 void SubanalysisWindow::abort()
  70 {
  71   model.clear();
  72   hide();
  73 }
  74
  75 void SubanalysisWindow::run()
  76 {
  77   if (window == 0 or threshold == 0) {
  78     throw std::runtime_error("SubanalysisWindow misconstructed");
  79   }
  80
  81   if (model.size() == 0) {
  82     throw std::runtime_error("It shouldn't be possible to call run with an "
  83                              "empty model now.");
  84   }
  85
  86   MussaRef m(new Mussa);
  87
  88   for(SequenceLocationModel::iterator itor = model.begin();
  89       itor != model.end();
  90       ++itor)
  91   {
  92     // append_sequence from a const Sequence & will make a copy
  93     // for the shared pointer.
  94     m->append_sequence(itor->getSelectedSequence());
  95   }
  96
  97   m->set_window(window->value());
  98   m->set_threshold(threshold->value());
  99   m->analyze();
 100   MussaWindow *mw = new MussaWindow(m);
 101   mw->show();
 102   model.clear();
 103   hide();
 104 }
 105
 106 void SubanalysisWindow::modelUpdated(const QModelIndex&, int, int )
 107 {
 108   // if the model is empty we shouldn't be able to click ok
 109   if (ok) ok->setEnabled(not model.empty());
 110 }
 111
 112 void SubanalysisWindow::updateTitle()
 113 {
 114   std::string title("Subanalysis: ");
 115   if (analysis) {
 116     title += analysis->get_title();
 117   }
 118   setWindowTitle(title.c_str());
 119 }