qui/SubanalysisWindow.cpp

   1 #include "qui/SubanalysisWindow.hpp"
   2 #include "qui/MussaWindow.hpp"
   3
   4 #include "mussa_exceptions.hpp"
   5 #include "alg/mussa.hpp"
   6
   7 #include <QVBoxLayout>
   8 #include <QHBoxLayout>
   9 #include <QGridLayout>
  10
  11 SubanalysisWindow::SubanalysisWindow(QWidget *parent)
  12   : QWidget(parent),
  13     window(0),
  14     threshold(0),
  15     table(0),
  16     ok(0),
  17     cancel(0)
  18 {
  19   QGridLayout *parameterLayout = new QGridLayout;
  20
  21   QLabel *thresholdLabel = new QLabel(tr("threshold (bp)"));
  22   parameterLayout->addWidget(thresholdLabel, 0, 0);
  23   threshold = new QSpinBox(this);
  24   threshold->setValue(8);
  25   parameterLayout->addWidget(threshold, 1, 0);
  26   QLabel *windowLabel = new QLabel(tr("window (bp)"));
  27   parameterLayout->addWidget(windowLabel, 0, 1);
  28   window = new QSpinBox(this);
  29   window->setValue(10);
  30   parameterLayout->addWidget(window, 1, 1);
  31
  32   ok = new QPushButton(tr("&OK"), this);
  33   ok->setEnabled( false );
  34   connect(ok, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(run()));
  35
  36   cancel = new QPushButton(tr("Cancel"), this);
  37   connect(cancel, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(abort()));
  38
  39   table = new QTableView(this);
  40   table->setModel(&model);
  41
  42   // layout buttons
  43   QHBoxLayout *buttonLayout = new QHBoxLayout;
  44   buttonLayout->addWidget(ok);
  45   buttonLayout->addWidget(cancel);
  46
  47   // layout verticle space
  48   QVBoxLayout *verticalLayout = new QVBoxLayout;
  49   verticalLayout->addLayout(parameterLayout);
  50   verticalLayout->addWidget(table);
  51   verticalLayout->addLayout(buttonLayout);
  52   setLayout(verticalLayout);
  53
  54   // now that we're all setup lets get notices when we're updated
  55   connect(&model, SIGNAL(rowsInserted(const QModelIndex&, int, int)),
  56           this, SLOT(modelUpdated(const QModelIndex&, int, int)));
  57   connect(&model, SIGNAL(rowsRemoved(const QModelIndex&, int, int)),
  58           this, SLOT(modelUpdated(const QModelIndex&, int, int)));
  59 }
  60
  61 SequenceLocationModel& SubanalysisWindow::getModel()
  62 {
  63   return model;
  64 }
  65
  66 void SubanalysisWindow::abort()
  67 {
  68   model.clear();
  69   hide();
  70 }
  71
  72 void SubanalysisWindow::run()
  73 {
  74   if (window == 0 or threshold == 0) {
  75     throw std::runtime_error("SubanalysisWindow misconstructed");
  76   }
  77
  78   if (model.size() == 0) {
  79     throw std::runtime_error("It shouldn't be possible to call run with an "
  80                              "empty model now.");
  81   }
  82
  83   std::auto_ptr<Mussa> m(new Mussa);
  84
  85   for(SequenceLocationModel::iterator itor = model.begin();
  86       itor != model.end();
  87       ++itor)
  88   {
  89     // append_sequence from a const Sequence & will make a copy
  90     // for the shared pointer.
  91     m->append_sequence(itor->getSelectedSequence());
  92   }
  93
  94   m->set_window(window->value());
  95   m->set_threshold(threshold->value());
  96   m->analyze();
  97   MussaWindow *mw = new MussaWindow(m.get());
  98   mw->show();
  99   model.clear();
 100   hide();
 101 }
 102
 103 void SubanalysisWindow::modelUpdated(const QModelIndex&, int, int )
 104 {
 105   // if the model is empty we shouldn't be able to click ok
 106   if (ok) ok->setEnabled(not model.empty());
 107 }