qui/motif_editor/MotifEditor.cpp

   1 #include "qui/motif_editor/MotifEditor.hpp"
   2 #include "alg/sequence.hpp"
   3
   4 #include <set>
   5 #include <string>
   6
   7 using namespace std;
   8
   9 MotifEditor::MotifEditor(Mussa *m, QWidget *parent)
  10   : QWidget(parent),
  11     analysis(m),
  12     applyButton("set motifs")
  13 {
  14   assert (m != 0);
  15   const set<string> &motif = analysis->motifs();
  16   vector<string> motif_seq(motif.begin(), motif.end());
  17
  18   connect(&applyButton, SIGNAL(clicked()), this, SLOT(updateMotifs()));
  19   layout.addWidget(&applyButton);
  20
  21   for(size_t i=0; i != 10; ++i)
  22   {
  23     MotifDetail *detail = new MotifDetail;
  24     if (i < motif_seq.size()) {
  25       detail->setMotif(motif_seq[i]);
  26       detail->setColor(analysis->colorMapper().lookup("motif", motif_seq[i]));
  27     }
  28     motif_details.push_back(detail);
  29     layout.addWidget(detail);
  30   }
  31   setLayout(&layout);
  32 }
  33
  34 MotifEditor::MotifEditor(const MotifEditor& me)
  35   : QWidget((QWidget*)me.parent()),
  36     analysis(me.analysis),
  37     applyButton(me.applyButton.text())
  38 {
  39 }
  40
  41 void MotifEditor::updateMotifs()
  42 {
  43   // This function is _sooo_ not thread safe
  44   // erase motifs
  45   Color motif_default = analysis->colorMapper().typeColor("motif");
  46   analysis->colorMapper().erase("motif");
  47   analysis->colorMapper().appendTypeColor("motif", motif_default);
  48
  49   // add our motifs back
  50   vector<string> motifs;
  51   vector<Color> colors;
  52
  53   for(std::vector<MotifDetail *>::iterator md_i =  motif_details.begin();
  54       md_i != motif_details.end();
  55       ++md_i)
  56   {
  57     if ((*md_i)->motif().size() > 0) {
  58       motifs.push_back((*md_i)->motif());
  59       colors.push_back((*md_i)->color());
  60     }
  61   }
  62   analysis->add_motifs(motifs, colors);
  63
  64   emit changedMotifs();
  65 }
  66
  67 //MotifEditor::
  68