qui/seqbrowser/SequenceBrowserWidget.hpp

   1 #ifndef _PATH_WIDGET_H_
   2 #define _PATH_WIDGET_H_
   3
   4 #include <vector>
   5
   6 #include <QWidget>
   7
   8 #include "alg/sequence.hpp"
   9 #include "alg/glsequence.hpp"
  10 #include "qui/seqbrowser/ScrollableSequenceBrowser.hpp"
  11 #include "qui/seqbrowser/SequenceBrowserSidebar.hpp"
  12
  13 //! the master widget that makes a useful Sequence Browser
  14 class SequenceBrowserWidget : public QWidget
  15 {
  16   Q_OBJECT
  17
  18 public:
  19   SequenceBrowserWidget(QWidget *parent=0);
  20
  21   //! return current zoom size
  22   double zoom();
  23
  24   //! reset all of our stored data back to the empty state
  25   void clear();
  26
  27   /* Attach sequences to our browser, its best to attach them all
  28    * at once, as otherwise the Sidebar has some rendering trouble
  29    * as it draw and redraws the SequenceDescriptions in the various
  30    * positions.
  31    */
  32   //void push_sequences(std::vector<Sequence>& sequences);
  33   void setSequences(const std::vector<Sequence>& sequences, AnnotationColors& cm);
  34   void setSequences(std::vector<GlSequence>& sequences);
  35   const std::vector<GlSequence>& sequences() const;
  36
  37   //! reset just the links we're displaying
  38   void clear_links();
  39   //! set per species links
  40   void link(const std::vector<int> &path, const std::vector<bool>& isRC, int length);
  41   // return set of pathids defined by order of link calls
  42   const std::set<int> selectedPaths() const;
  43   void centerOnPath(const std::vector<int>& paths);
  44
  45 public slots:
  46   //! set the zoom level of our browser
  47   void setZoom(double);
  48   //! zoom to fit the whole scene on the screen
  49   double zoomOut();
  50   //! zoom to sequence
  51   double zoomToSequence();
  52
  53   void updatePosition();
  54   //! ask the user where to save an image of the current browser view
  55   void promptSaveBrowserPixmap();
  56
  57   void update();
  58
  59 private:
  60   ScrollableSequenceBrowser scrollable_browser;
  61   SequenceBrowserSidebar left_sidebar;
  62   SequenceBrowserSidebar right_sidebar;
  63
  64   //! sequences created by a setSequences(vector<Sequences>) call
  65   /*! I need to save them so i can free them to avoid a memory leak
  66    */
  67   std::vector<GlSequence> converted_sequences;
  68 };
  69 #endif