qui/seqbrowser/SequenceDescription.cpp

   1 #include "qui/seqbrowser/SequenceDescription.hpp"
   2
   3 using namespace std;
   4
   5 SequenceDescription::SequenceDescription(QWidget *parent)
   6   : QFrame(parent),
   7     layout(0),
   8     name_label(0),
   9     position_label(0),
  10     length_label(0),
  11     pos(-1) // set pos to an invalid value so the setPos function will call
  12             // setText
  13 {
  14   setupWidgets();
  15 }
  16
  17 SequenceDescription::SequenceDescription(
  18     boost::shared_ptr<GlSequence> glseq,
  19     QWidget *parent
  20 ) : QFrame(parent)
  21 {
  22   setupWidgets();
  23   setGlSequence(glseq);
  24 }
  25
  26 void SequenceDescription::setupWidgets()
  27 {
  28   layout = new QVBoxLayout;
  29   name_label = new QLineEdit;
  30   position_label = new QLabel;
  31   length_label = new QLabel;
  32
  33   setFrameStyle(QFrame::Panel | QFrame::Sunken);
  34   setLineWidth(1);
  35
  36   // What's this feature descriptions
  37   // FIXME: The '*' is added because for some reason
  38   // Qt's whatsthis feature is chopping off the last word
  39   // If the '*' eventually shows up in a whatsthis pop-up
  40   // then the '*' should be removed.
  41   name_label->setWhatsThis("Name of sequence *");
  42   position_label->setWhatsThis("Edge of viewport base pair position *");
  43   length_label->setWhatsThis("Total length of sequence *");
  44
  45   layout->addWidget(name_label);
  46   layout->addWidget(position_label);
  47   layout->addWidget(length_label);
  48   name_label->setMaximumWidth(length_label->fontMetrics().width("01234567"));
  49   setLayout(layout);
  50   connect(name_label, SIGNAL(textChanged(const QString& )),
  51           this, SLOT(setName(const QString& )));
  52 }
  53
  54 void SequenceDescription::setGlSequence(
  55   boost::shared_ptr<GlSequence> glseq  )
  56 {
  57   if (glseq != glsequence_) {
  58     glsequence_ = glseq;
  59     setName(glsequence_->sequence()->get_species());
  60     setLength(glsequence_->sequence()->length());
  61     emit glsequenceChanged(glsequence_);
  62   }
  63 }
  64
  65 boost::shared_ptr<GlSequence> SequenceDescription::glsequence()
  66 {
  67   return glsequence_;
  68 }
  69
  70 void SequenceDescription::setName(std::string name)
  71 {
  72   setName(QString(name.c_str()));
  73 }
  74
  75 void SequenceDescription::setName(const QString& name_)
  76 {
  77   std::string std_name_ = name_.toStdString();
  78
  79   if (std_name_ != glsequence_->sequence()->get_species()) {
  80     glsequence_->sequence()->set_species(std_name_);
  81     emit nameChanged(name_);
  82   }
  83
  84     // no need to setText again if its because of user editing
  85   if (name_ != name_label->text()) {
  86     name_label->setText(name_);
  87     name_label->setCursorPosition(0);
  88   }
  89 }
  90
  91 std::string SequenceDescription::name() const
  92 {
  93   if (glsequence_)
  94     return glsequence_->sequence()->get_species();
  95   else
  96     return string("");
  97 }
  98
  99 void SequenceDescription::setLength(int length)
 100 {
 101   QString s;
 102   float short_length = length;
 103   if (short_length > 1000000) {
 104     short_length /= 1000000;
 105     s.setNum(short_length, 'f', 2);
 106     s += "mb";
 107   } if (short_length > 1000) {
 108     short_length /= 1000;
 109     s.setNum(short_length, 'f', 2);
 110     s += "kb";
 111   } else {
 112     s.setNum(short_length);
 113     s += "b";
 114   }
 115   length_label->setText(s);
 116 }
 117
 118 int SequenceDescription::length() const
 119 {
 120   return 0;
 121
 122   if (glsequence_)
 123     return glsequence_->sequence()->size();
 124   else
 125     return 0;
 126 }
 127
 128 void SequenceDescription::setPosition(int pos_)
 129 {
 130   QString s;
 131   if (pos != pos_) {
 132     pos = pos_;
 133     position_label->setText(s.setNum(pos_));
 134     emit positionChanged(pos);
 135   }
 136 }
 137
 138 int SequenceDescription::position() const
 139 {
 140   return pos;
 141 }