qui/seqbrowser/SequenceDescription.cpp

   1 #include <QVBoxLayout>
   2 #include "qui/seqbrowser/SequenceDescription.hpp"
   3
   4 using namespace std;
   5
   6 SequenceDescription::SequenceDescription(QWidget *parent)
   7   : QFrame(parent),
   8     pos(-1) // set pos to an invalid value so the setPos function will call
   9             // setText
  10 {
  11   createWidget();
  12 }
  13
  14 SequenceDescription::SequenceDescription(
  15     boost::shared_ptr<GlSequence> glseq,
  16     QWidget *parent
  17 ) : QFrame(parent)
  18 {
  19   setGlSequence(glseq);
  20 }
  21
  22 void SequenceDescription::createWidget()
  23 {
  24   setFrameStyle(QFrame::Panel | QFrame::Sunken);
  25   setLineWidth(1);
  26   QLayout *layout = new QVBoxLayout;
  27   layout->addWidget(&name_label);
  28   layout->addWidget(&length_label);
  29   layout->addWidget(&position_label);
  30   name_label.setMaximumWidth(length_label.fontMetrics().width("01234567"));
  31   setLayout(layout);
  32
  33   connect(&name_label, SIGNAL(textChanged(const QString& )),
  34           this, SLOT(setName(const QString& )));
  35 }
  36
  37 void SequenceDescription::setGlSequence(
  38   boost::shared_ptr<GlSequence> glseq  )
  39 {
  40   if (glseq != glsequence_) {
  41     glsequence_ = glseq;
  42     setName(glsequence_->sequence()->get_species());
  43     setLength(glsequence_->sequence()->length());
  44     emit glsequenceChanged(glsequence_);
  45   }
  46 }
  47
  48 boost::shared_ptr<GlSequence> SequenceDescription::glsequence()
  49 {
  50   return glsequence_;
  51 }
  52
  53 void SequenceDescription::setName(std::string name)
  54 {
  55   setName(QString(name.c_str()));
  56 }
  57
  58 void SequenceDescription::setName(const QString& name_)
  59 {
  60   std::string std_name_ = name_.toStdString();
  61
  62   if (std_name_ != glsequence_->sequence()->get_species()) {
  63     glsequence_->sequence()->set_species(std_name_);
  64     emit nameChanged(name_);
  65   }
  66
  67     // no need to setText again if its because of user editing
  68   if (name_ != name_label.text()) {
  69     name_label.setText(name_);
  70   }
  71 }
  72
  73 std::string SequenceDescription::name() const
  74 {
  75   if (glsequence_)
  76     return glsequence_->sequence()->get_species();
  77   else
  78     return string("");
  79 }
  80
  81 void SequenceDescription::setLength(int length)
  82 {
  83   QString s;
  84   float short_length = length;
  85   if (short_length > 1000000) {
  86     short_length /= 1000000;
  87     s.setNum(short_length, 'f', 2);
  88     s += "mb";
  89   } if (short_length > 1000) {
  90     short_length /= 1000;
  91     s.setNum(short_length, 'f', 2);
  92     s += "kb";
  93   } else {
  94     s.setNum(short_length);
  95     s += "b";
  96   }
  97   length_label.setText(s);
  98 }
  99
 100 int SequenceDescription::length() const
 101 {
 102   return 0;
 103
 104   if (glsequence_)
 105     return glsequence_->sequence()->size();
 106   else
 107     return 0;
 108 }
 109
 110 void SequenceDescription::setPosition(int pos_)
 111 {
 112   QString s;
 113   if (pos != pos_) {
 114     pos = pos_;
 115     position_label.setText(s.setNum(pos_));
 116     emit positionChanged(pos);
 117   }
 118 }
 119
 120 int SequenceDescription::position() const
 121 {
 122   return pos;
 123 }