tests/ex3.sam

   1 @HD     VN:1.0
   2 @SQ     SN:chr1 LN:1575
   3 @SQ     SN:chr2 LN:1584
   4 @RG     ID:L1   PU:SC_1_10      LB:SC_1 SM:NA12891      CN:name:with:colon
   5 @RG     ID:L2   PU:SC_2_12      LB:SC_2 SM:NA12891      CN:name:with:colon
   6 @PG     ID:P1   VN:1.0
   7 @PG     ID:P2   VN:1.1
   8 @CO     this is a comment
   9 @CO     this is another comment
  10 read_28833_29006_6945   99      chr1    33      20      10M1D25M        =       200     167     AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG     <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<     NM:i:1  RG:Z:L1 PG:Z:P1 XT:A:U
  11 read_28701_28881_323b   147     chr2    88      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<     MF:i:18 RG:Z:L2 PG:Z:P2 XT:A:R
  12 read_28701_28881_323c   147     chr2    88      30      35M     =       500     412     ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA     <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<
  13