woldlab.caltech.edu Git - pysam.git/tree

drwxr-xr-x		..
-rw-r--r--	11867	bam.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	24548	bam.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	7949	bam2bcf.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1434	bam2bcf.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	16986	bam2bcf_indel.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	4572	bam2depth.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	4104	bam_aux.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5826	bam_cat.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2823	bam_color.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1064	bam_endian.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	16169	bam_import.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	20987	bam_index.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5006	bam_lpileup.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	20585	bam_maqcns.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1486	bam_maqcns.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2562	bam_mate.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	11916	bam_md.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	12581	bam_pileup.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	35680	bam_plcmd.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5669	bam_rmdup.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	4149	bam_rmdupse.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	13772	bam_sort.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	3226	bam_stat.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	12785	bam_tview.c.pysam.c	blob \| history \| raw
drwxr-xr-x	-	bcftools	tree \| history
-rw-r--r--	3794	bedidx.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	19964	bgzf.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	4617	bgzf.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5691	cut_target.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	3505	errmod.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	442	errmod.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	10337	faidx.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	3188	faidx.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5959	glf.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1799	glf.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	15250	kaln.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2072	kaln.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	17815	khash.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	3472	klist.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	18376	knetfile.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1611	knetfile.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	10541	kprobaln.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	1568	kprobaln.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	8108	kseq.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	10027	ksort.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5396	kstring.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2661	kstring.h	blob \| history \| raw
drwxr-xr-x	-	misc	tree \| history
-rw-r--r--	1264	msvc_compat.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	20863	phase.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	82	pysam.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	24377	razf.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	4137	razf.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	5915	sam.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2625	sam.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	19284	sam_header.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	643	sam_header.h	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	12160	sam_view.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	2552	sample.c.pysam.c	blob \| history \| raw
-rw-r--r--	396	sample.h	blob \| history \| raw
drwxr-xr-x	-	win32	tree \| history