NEWS

   1 Beta Release 0.2.2 (28 June, 2010)
   2 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
   3
   4 Notable changes:
   5
   6  * Dropped the VCF3 support. Added VCF4 support.
   7
   8  * Avoided the function name collision with samtools.
   9
  10 (0.2.2: 28 June 2010, r603)
  11
  12
  13
  14 Beta Release 0.2.1 (3 June, 2010)
  15 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
  16
  17 Notable changes:
  18
  19  * Allow shared library to be compiled. Added python binding to the
  20    shared library.
  21
  22 (0.2.1: 3 June 2010, r582)
  23
  24
  25
  26 Beta Release 0.2.0 (11 May, 2010)
  27 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
  28
  29 Notable changes:
  30
  31  * Fixed an issue for random access given an interval end larger than
  32    2^29.
  33
  34  * Updated the Java binding.
  35
  36  * Added a Perl module using XS.
  37
  38  * Improved the C APIs.
  39
  40 (0.2.0: 11 May 2010, r574)
  41
  42
  43
  44 Beta Release 0.1.6 (9 May, 2010)
  45 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
  46
  47 Notable changes:
  48
  49  * Improved backward compatibility. Release 0.1.5 does not work with the
  50    buggy index file generated by 0.1.2.
  51
  52  * Fixed a bug in building linear index. The bug does not affect the
  53    results, only affects efficiency in rare cases.
  54
  55  * Reduced the number of seek calls given an index generated by old
  56    version of tabix.
  57
  58  * Added new APIs for retrieving data via an iterator. The old callback
  59    APIs are not changed, although internally it uses iterator to
  60    retrieve data.
  61
  62 I am trying to freeze tabix. I just hope I am committing new bugs.
  63
  64 (0.1.6: 9 May 2010, r563)
  65
  66
  67
  68 Beta Release 0.1.5 (5 May, 2010)
  69 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
  70
  71 Notable changes:
  72
  73  * Clarified that tabix is released under MIT/X11.
  74
  75  * Improved the robustness of indexing and retrieval.
  76
  77  * Reduced the number of seek calls when the specified region starts
  78    from a 16kb block with no data. The index format is the same, but the
  79    content is changed a little.
  80
  81 (0.1.5: 5 May 2010, r560)