alg/glseqbrowser.hpp

   1 #ifndef _GLTRACKS_H_
   2 #define _GLTRACKS_H_
   3
   4 #include <map>
   5 #include <set>
   6 #include <vector>
   7
   8 #include "alg/annotation_colors.hpp"
   9 #include "alg/sequence.hpp"
  10 #include "alg/glsequence.hpp"
  11
  12 //! Manage rendering a collection of glSequences
  13 class GlSeqBrowser
  14 {
  15 public:
  16   GlSeqBrowser();
  17   GlSeqBrowser(const GlSeqBrowser&);
  18
  19   //! setup the opengl canvas
  20   void initializeGL();
  21   //! called when our screen canvas is resized
  22   void resizeGL(int width, int height);
  23   //! render our scene
  24   void paintGL() const;
  25
  26   //! select a region (using canvas coordinates)
  27   void GlSeqBrowser::selectRegion(int top, int left, int bottom, int right);
  28
  29   //! border size
  30   float border() const;
  31
  32   //! max world left coordinate
  33   float left() const;
  34   //! max world right coordinate
  35   float right() const;
  36
  37   void setViewportCenter(float x);
  38   float viewportLeft() const;
  39   float viewportCenter() const;
  40   float viewportRight() const;
  41   float viewportHeight() const;
  42   float viewportWidth() const;
  43
  44   void setZoom(int zoom_level);
  45   int zoom() const;
  46
  47   void setColorMapper(AnnotationColors& cm);
  48   AnnotationColors& colorMapper();
  49
  50   //! clear our tracks and connections
  51   void clear();
  52
  53   //! add a sequence to the back of our track container
  54   void push_sequence(const Sequence &s);
  55   //! add a glsequence to the back of our track container
  56   void push_sequence(GlSequence &s);
  57   //! return our track container
  58   const std::vector<GlSequence>& sequences() const;
  59
  60   //! clear all the line segments between all the sequences
  61   void clear_links();
  62   //! define a path
  63   void link(const std::vector<int>& path, const std::vector<bool>& isRC, int length);
  64   //! returns the index of pathids based on order added by link
  65   const std::set<int>& selectedPaths() const;
  66   //! center the provided path in the current viewport
  67   void centerOnPath(const std::vector<int>&);
  68
  69   //! Provide a logical name for a type discriminator for our glName stack
  70   enum FeatureType { MussaTrack, MussaSegment };
  71
  72   //! a useful point class
  73   template<class T> struct point {
  74     T x;
  75     T y;
  76
  77     point(T x_, T y_):x(x_), y(y_) {}
  78   };
  79
  80   //! a useful rectangle, where 0,0 is in the lower left
  81   template<class T> struct rect {
  82     T top;
  83     T left;
  84     T bottom;
  85     T right;
  86
  87     rect() {}
  88     rect(T t, T l, T b, T r) : top(t), left(l), bottom(b), right(r) {}
  89     T width() { return right - left; }
  90     T height() { return top - bottom; }
  91   };
  92
  93   struct Segment
  94   {
  95     point<float> start;
  96     point<float> end;
  97     bool reversed;
  98     std::set<int> path_ids;
  99
 100     Segment() : start(0.0, 0.0), end(0.0, 0.0) {}
 101     Segment(float x1, float y1, float x2, float y2, bool isRC)
 102       : start(x1, y1), end(x2, y2), reversed(isRC) {}
 103   };
 104
 105   //! data structure holding our line segments
 106   /*! the vector is of size track_container.size()-1
 107    *  it's indexed by the pair x1, x2 (the two x coordinates between
 108    *  the two tracks
 109    */
 110   typedef std::pair<int, int> segment_key;
 111   typedef std::map<segment_key, Segment> pair_segment_map;
 112   typedef std::vector<pair_segment_map> path_segment_map_vector;
 113   path_segment_map_vector path_segments;
 114 private:
 115   //! recalculate the viewable world
 116   /*! depending on the size of our canvas, our zoom level and
 117    *  how far we've been offset
 118    */
 119   void update_viewport(float center, int new_zoom);
 120
 121   //! determine where all the tracks should be placed
 122   void update_layout();
 123
 124   //! convert opengl selections into the list of paths we should highlight
 125   void processSelection(GLuint hits, GLuint buffer[], GLuint bufsize);
 126
 127   //! master scene drawing function
 128   /*! draw is broken out for the opengl selection code
 129    */
 130   void draw() const;
 131   //! draw glsequence tracks
 132   void draw_tracks() const;
 133   //! draw line segments between tracks
 134   void draw_segments() const;
 135   //! draw selection box
 136   void draw_selection() const;
 137
 138   //! number of pixels to reserve around the edges of our canvas
 139   const int border_width;
 140   //! the maximum dimensions that our scene is taking up (world coord)
 141   rect<float> max_ortho;
 142   //! the current viewable region (world coord)
 143   rect<float> cur_ortho;
 144   //! how many pixels our viewport is (screen coord)
 145   point<int> viewport_size;
 146   //! the center of our current viewport (world coord) (used for scrollbar)
 147   float viewport_center;
 148   int zoom_level;
 149   AnnotationColors color_mapper;
 150   //! container of all the GlSequences loaded into our scene
 151   std::vector<GlSequence> track_container;
 152   //! counter for each path added to us via connect
 153   int pathid;
 154
 155 protected:
 156   //! where to draw our box
 157   rect<float> selectedRegion;
 158   //! true if we have a selection
 159   bool selectedMode;
 160   //! indicate which paths are selected
 161   std::set<int> selected_paths;
 162   //! which track is selected (it only makes sense to have one track selected).
 163   std::set<int> selected_tracks;
 164
 165 };
 166 #endif