alg/glseqbrowser.hpp

   1 #ifndef _GLTRACKS_H_
   2 #define _GLTRACKS_H_
   3
   4 #include <map>
   5 #include <set>
   6 #include <vector>
   7
   8 #include "alg/annotation_colors.hpp"
   9 #include "alg/sequence.hpp"
  10 #include "alg/glsequence.hpp"
  11
  12 //! Manage rendering a collection of glSequences
  13 class GlSeqBrowser
  14 {
  15 public:
  16   GlSeqBrowser();
  17   GlSeqBrowser(const GlSeqBrowser&);
  18
  19   //! setup the opengl canvas
  20   void initializeGL();
  21   //! called when our screen canvas is resized
  22   void resizeGL(int width, int height);
  23   //! render our scene
  24   void paintGL() const;
  25
  26   //! select a region (using canvas coordinates)
  27   void GlSeqBrowser::selectRegion(int top, int left, int bottom, int right);
  28
  29   //! max world left coordinate
  30   float left() const;
  31   //! max world right coordinate
  32   float right() const;
  33
  34   void setViewportCenter(float x);
  35   float viewportLeft() const;
  36   float viewportCenter() const;
  37   float viewportRight() const;
  38   float viewportHeight() const;
  39   float viewportWidth() const;
  40
  41   void setZoom(int zoom_level);
  42   int zoom() const;
  43
  44   void setColorMapper(AnnotationColors& cm);
  45   AnnotationColors& colorMapper();
  46
  47   //! clear our tracks and connections
  48   void clear();
  49
  50   //! add a sequence to the back of our track container
  51   void push_sequence(const Sequence &s);
  52   //! add a glsequence to the back of our track container
  53   void push_sequence(GlSequence &s);
  54   //! return our track container
  55   const std::vector<GlSequence>& sequences() const;
  56
  57   //! clear all the line segments between all the sequences
  58   void clear_links();
  59   //! define a path
  60   void link(const std::vector<int>& path, const std::vector<bool>& isRC, int length);
  61   //! returns the index of pathids based on order added by link
  62   const std::set<int>& selectedPaths() const;
  63
  64   //! Provide a logical name for a type discriminator for our glName stack
  65   enum FeatureType { MussaTrack, MussaSegment };
  66
  67   //! a useful point class
  68   template<class T> struct point {
  69     T x;
  70     T y;
  71
  72     point(T x_, T y_):x(x_), y(y_) {}
  73   };
  74
  75   //! a useful rectangle, where 0,0 is in the lower left
  76   template<class T> struct rect {
  77     T top;
  78     T left;
  79     T bottom;
  80     T right;
  81
  82     rect() {}
  83     rect(T t, T l, T b, T r) : top(t), left(l), bottom(b), right(r) {}
  84     T width() { return right - left; }
  85     T height() { return top - bottom; }
  86   };
  87
  88   struct Segment
  89   {
  90     point<float> start;
  91     point<float> end;
  92     bool reversed;
  93     std::set<int> path_ids;
  94
  95     Segment() : start(0.0, 0.0), end(0.0, 0.0) {}
  96     Segment(float x1, float y1, float x2, float y2, bool isRC)
  97       : start(x1, y1), end(x2, y2), reversed(isRC) {}
  98   };
  99
 100   //! data structure holding our line segments
 101   /*! the vector is of size track_container.size()-1
 102    *  it's indexed by the pair x1, x2 (the two x coordinates between
 103    *  the two tracks
 104    */
 105   typedef std::pair<int, int> segment_key;
 106   typedef std::map<segment_key, Segment> pair_segment_map;
 107   typedef std::vector<pair_segment_map> path_segment_map_vector;
 108   path_segment_map_vector path_segments;
 109 private:
 110   //! recalculate the viewable world
 111   /*! depending on the size of our canvas, our zoom level and
 112    *  how far we've been offset
 113    */
 114   void update_viewport(float center, int new_zoom);
 115
 116   //! determine where all the tracks should be placed
 117   void update_layout();
 118
 119   //! convert opengl selections into the list of paths we should highlight
 120   void processSelection(GLuint hits, GLuint buffer[], GLuint bufsize);
 121
 122   //! master scene drawing function
 123   /*! draw is broken out for the opengl selection code
 124    */
 125   void draw() const;
 126   //! draw glsequence tracks
 127   void draw_tracks() const;
 128   //! draw line segments between tracks
 129   void draw_segments() const;
 130   //! draw selection box
 131   void draw_selection() const;
 132
 133   //! number of pixels to reserve around the edges of our canvas
 134   const int border;
 135   //! the maximum dimensions that our scene is taking up (world coord)
 136   rect<float> max_ortho;
 137   //! the current viewable region (world coord)
 138   rect<float> cur_ortho;
 139   //! how many pixels our viewport is (screen coord)
 140   point<int> viewport_size;
 141   //! the center of our current viewport (world coord) (used for scrollbar)
 142   float viewport_center;
 143   int zoom_level;
 144   AnnotationColors color_mapper;
 145   //! container of all the GlSequences loaded into our scene
 146   std::vector<GlSequence> track_container;
 147   //! counter for each path added to us via connect
 148   int pathid;
 149
 150 protected:
 151   //! where to draw our box
 152   rect<float> selectedRegion;
 153   //! true if we have a selection
 154   bool selectedMode;
 155   //! indicate which paths are selected
 156   std::set<int> selected_paths;
 157   //! which track is selected (it only makes sense to have one track selected).
 158   std::set<int> selected_tracks;
 159
 160 };
 161 #endif