gui/ConnWindow.hh

   1 #ifndef _MUSSA_GUI_CONN_WINDOW_H_
   2 #define _MUSSA_GUI_CONN_WINDOW_H_
   3
   4 //  This file is part of the Mussa source distribution.
   5 //  http://mussa.caltech.edu/
   6 //  Contact author: Tristan  De Buysscher, tristan@caltech.edu
   7
   8 // This program and all associated source code files are Copyright (C) 2005
   9 // the California Institute of Technology, Pasadena, CA, 91125 USA.  It is
  10 // under the GNU Public License; please see the included LICENSE.txt
  11 // file for more information, or contact Tristan directly.
  12
  13 #include <string>
  14
  15 #include <FL/Fl_Double_Window.H>
  16 #include <FL/Fl_Menu_Bar.H>
  17 #include <FL/Fl_Menu_Item.H>
  18
  19 #include "ConnView.hh"
  20 #include "SetupWindow.hh"
  21 #include "SubAnalysisWindow.hh"
  22 #include "SeqTextWindow.hh"
  23
  24 //! Window for showing the lines connecting the various sequences together
  25 class ConnWindow : public Fl_Double_Window
  26 {
  27   private:
  28     Mussa *an_analysis, *sub_analysis;
  29     ConnWindow *sub_conn_win;
  30
  31     Fl_Menu_Button *file_menu;
  32     Fl_Menu_Button *view_menu;
  33     Fl_Menu_Bar *menu_bar;
  34     Fl_Input *bar_input;
  35     Fl_Input *line_input;
  36     Fl_Input *thres_input;
  37     ConnView *conn_box;
  38     SetupWindow *setup_win;
  39     SubAnalysisWindow *subana_win;
  40     SeqTextWindow *show_seq_win;
  41     int padding, name_pad;
  42     std::string window_name;
  43
  44   public:
  45     ConnWindow(int w, int h, const char* title);
  46     ~ConnWindow();
  47     void add_ana(Mussa *the_ana);
  48
  49     void real_load_ana_cb();
  50     void real_do_ana_cb();
  51     void real_setup_ana_cb();
  52     void real_subana_cb();
  53     void real_resthres();
  54     void real_seq_show_cb();
  55
  56     void real_seq_win_spawn_cb();
  57     void real_motif_find_cb();
  58     void real_annot_win_cb();
  59
  60     void real_toggle_bars_cb();
  61     void real_set_bar_len_cb(Fl_Input* o);
  62     void real_toggle_lines_cb();
  63     void real_set_line_len_cb(Fl_Input* o);
  64     void real_set_soft_thres_cb(Fl_Input* o);
  65 };
  66
  67 #endif