qui/seqbrowser/SequenceBrowserWidget.hpp

   1 #ifndef _PATH_WIDGET_H_
   2 #define _PATH_WIDGET_H_
   3
   4 #include <vector>
   5
   6 #include <QSplitter>
   7
   8 #include "alg/sequence.hpp"
   9 #include "alg/glsequence.hpp"
  10 #include "qui/seqbrowser/ScrollableSequenceBrowser.hpp"
  11 #include "qui/seqbrowser/SequenceBrowserSidebar.hpp"
  12
  13 //! the master widget that makes a useful Sequence Browser
  14 class SequenceBrowserWidget : public QSplitter
  15 {
  16   Q_OBJECT
  17
  18 public:
  19   SequenceBrowserWidget(QWidget *parent=0);
  20
  21   //SequenceBrowser& browser() { return scrollable_browser.browser(); }
  22
  23   //! reset all of our stored data back to the empty state
  24   void clear();
  25
  26   /* Attach sequences to our browser, its best to attach them all
  27    * at once, as otherwise the Sidebar has some rendering trouble
  28    * as it draw and redraws the SequenceDescriptions in the various
  29    * positions.
  30    */
  31   //void push_sequences(std::vector<Sequence>& sequences);
  32   void setSequences(const std::vector<Sequence>& sequences, AnnotationColors& cm);
  33   void setSequences(std::vector<GlSequence>& sequences);
  34   const std::vector<GlSequence>& sequences() const;
  35
  36   //! reset just the links we're displaying
  37   void clear_links();
  38   //! set per species links
  39   void link(const std::vector<int> &path, const std::vector<bool>& isRC, int length);
  40   // return set of pathids defined by order of link calls
  41   const std::set<int> selectedPaths() const;
  42   void centerOnPath(const std::vector<int>& paths);
  43
  44 public slots:
  45   //! set the zoom level of our browser
  46   void setZoom(int);
  47
  48   void updatePosition();
  49   //! ask the user where to save an image of the current browser view
  50   void promptSaveBrowserPixmap();
  51
  52 private:
  53   ScrollableSequenceBrowser scrollable_browser;
  54   SequenceBrowserSidebar left_sidebar;
  55   SequenceBrowserSidebar right_sidebar;
  56
  57   //! sequences created by a setSequences(vector<Sequences>) call
  58   /*! I need to save them so i can free them to avoid a memory leak
  59    */
  60   std::vector<GlSequence> converted_sequences;
  61 };
  62 #endif